Prokuratura Okręgowa w Warszawie wszczęła śledztwo dotyczące działalności zagranicznego oddziału Instytutu Pileckiego w Szwajcarii. Sprawa dotyczy zakupu zabytkowego hotelu Schwanen w Rapperswilu oraz możliwej niegospodarności związanej z tą inwestycją. Instytut, powołany za czasów rządów PiS, miał w budynku otworzyć zagraniczną placówkę badawczą, jednak obecnie funkcjonuje tam restauracja serwująca dania śródziemnomorskie.
Władze instytucji podczas zakupu nieruchomości korzystały z usług wyjątkowo drogich kancelarii prawnych, co wzbudziło zainteresowanie śledczych. Koszt zakupu budynku wyniósł aż 115 mln zł z publicznych pieniędzy. Mimo wcześniejszych zapowiedzi, rząd w 2024 roku zrezygnował z planu utworzenia w nim Muzeum Polskiego.
Obecnie rozważane są różne scenariusze dotyczące przyszłości tej kontrowersyjnej inwestycji – w tym sprzedaż hotelu oraz zamknięcie szwajcarskiego oddziału Instytutu.
Sprawa ma również wymiar polityczny. Krytycy obecnego dyrektora Instytutu, Krzysztofa Ruchniewicza, oskarżają go o niszczenie dorobku poprzedniej ekipy. Śledztwo zostało formalnie rozpoczęte 28 lipca 2025 roku i koncentruje się na działaniach spółki Pilecki-Institut (Schweiz) GmbH.